[생물 임용 노트]핵산 - 3) DNA : DNA의 특이적 구조

DNA의 특이적 구조의 원인

DNA의 특이적 구조는 Bending과 회문(palindrome) 구조에 의한 hairpin, cruci form 형성이 있다.

Bending

한 가닥에 아데노신(A) 잔기가 4개 이상 나타날 경우 Bending이 생길 수 있다. 연속되는 6개의 아데노신은 18º의 bending을 만들어낼 수 있다.

회문(palindrome)

DNA에서 두 가닥에 걸쳐 두 방향의 대칭성을 가지며 역반복서열이 나타나는 DNA 부분을 말한다.

→ 각각 가닥 내에서 자체적으로 상보적이어서 hairpin 구조, cruci form을 형성 할 수 있다.

만일 DNA 각 서열에 역반복 서열이 나타나는 경우는 거울상 반복이라고 한다. 이 경우는 상보적 서열이 없어 hairpin 구조, cruci form을 형성하지 못하기도 한다.

회문 구조와 거울상 반복의 예시

1. 회문

 

TTAGCACGTGCTAA →

← AATCGTGCACGATT

 

2. 거울상 반복

 

← TTAGCACCACGATT →

← AATCGTGGTGCTAA →

 

3. 회문 구조에 의한 hairpin 구조 형성

 

CASE1 > 단일 가닥 예시 - hairpin

- TGCGATACTCATCGCA - 

DNA hairpin 구조 예시

 

CASE2 > 이중 가닥 예시 - cruci form

- TGCGATACTCATCGCA - 

- ACGCTATGAGTAGCGT -

DNA cruci form 예시