숭늉의 연구일지

1. 단백질의 기능 단백질은 세포의 거의 모든 기능을 수행한다. → 효소, 구조, 수송, 운동, 저장, 신호, 수용체, 유전자 등에 관여한다. 1) 역동적인 분자로 기능이 항상 다른 분자와의 상호작용에 의존한다. 2) 다른 분자와의 가역적 결합을 수반한다. → ligand 결합이 종종 단백질의 입체 형태 변화를 야기한다. 2. 단백질과 리간의 상호작용 1) 단백질-리간드 상호작용의 정량적 표현 단백질에 대한 리간드의 친화도를 ka로 표현이 가능하다. → 평형 상수로 표현 ka는 결합 상수로 클수록 리간드의 단백질에 대한 친화력이 더 크다. 단백질의 리간드 결합부위 중 50%가 채워질 수 있는 리간드의 농도는 1/ka이라고 한다.(kd(해리상수) = 1/ka로 표현 가능하고, 작을수록 친화력이 크다.) [..

단백질의 3차 구조 폴리펩타이드 사슬 내 아미노산 R기간의 상호작용에 의해 형성되는 구조이다. 주된 결합력은 R기 사이의 소수성 상호작용, 이온 상호작용, 반 데르 발스 인력, 두 Cys간의 공유결합이다. 1. 섬유 단백질(fibrous protein) 대체로 가늘고 길며, 긴 가닥 혹은 판상으로 배열된 사슬의 형태를 띠고 있다. 단백질의 내외부에 소수성 아미노산이 높은 밀도로 존재한다. 1) α-케라틴; 오른손 감김 Ala, Val, Leu, Ile, Met, Phe 등 소수성 아미노산이 풍부하다. α-나선의 폴리펩타이드가 서로 꼬여 있는 형태이다. pf> 마이오신(4차구조) 4차 구조 형성 시 이황화 결합에 의해 안정화된다. 2) 콜라겐(collagen); 왼손 감김 1회전당 3개의 아미노산이 존재한..