숭늉의 연구일지

종결종결 코돈인 UAA, UAG, UGA 중 하나를 만날 때 일어난다. 이들과 상보적인 수소결합을 형성하는 tRNA가 존재하지 않으며, 대신에 방출인자(RF)가 정지 코돈에 결합하여 폴리펩타이드 C말단에 물 분자를 첨가하게 한다. 이 과정에 peptidyl transferase가 작용한다. 이후 리보솜은 폴리펩타이드와 mRNA를 방출하고 리보솜은 분리된다.세균은 RF1, RF2, RF3를 갖는다.진핵세포는 eRF를 갖는다.번역 저해 물질세균, 진핵세포 공통 저해 물질퓨로마이신(puromycin) :  아미노아실-tRNA와 유사한 구조이다. 대신에 A 자리에 삽입되어 번역을 중단시킨다.리신(ricin) : 진핵세포 리보솜의 60s 소단위체를 불활성화시킨다. 세균의 23 rRNA의 탈퓨린화를 일으킨다.세균 ..

신장(elongation)아미노아실-tRNA가 GTP와 결합되어 있는 신장 인자(Elongation factor)인 EF-Tu와 결합하여 복합체를 만들고, 70s 개시 전 복합체의 A 부위에 결합하면서 GTP가 가수분해 되어 EF-Tu와 GDP 복합체가 떨어져 나간다. 이후 EF-Ts에 의해 GDP는 해리되고 GTP가 결합하여 재생한다.  A site와 P site에 위치하는 tRNA 간의 펩타이드 결합은 50s 리보솜의 23s rRNA의 peptidyltransferase에 의해 촉매 된다. 개시 tRNA의 아미노산이 A site에서 tRNA로 전이된다. 리보솜이 mRNA 3'-end 쪽으로 한 코돈씩 이동한다. A site의 펩티딜-tRNA를 P site로 이동시키고 탈아실화된 tRNA를 P site..

개요개시, 신장, 종결 3단계로 구분된다.코돈과 새로 들어온 아미노아실-tRNA가 상보적으로 결합하여 A site에 결합한다.큰 소단위체가 자리를 이동한다.작은 소단위체가 mRNA 분자를 따라 3NT 이동 후 tRNA가 떨어져 나간다.개시(원핵생물 중심)30s 소단위체가 initiation factor인 IF-1, IF-3와 결합한다.IF-1 : tRNA의 A site 조기 결합을 억제한다. 또한 70s 복합체를 50s와 30s로 분리시키는 것도 수행한다.IF-3 : 50s 소단위체 결합을 억제한다.이후 mRNA에 30s 소단위체가 결합한다. 이때 16s rRNA가 SD 서열과 상보적 수소결합을 한다.1의 복합체에 fMet-tRNAfMet과 GTP가 결합된 IF-2가 결합하여 30s 개시 전 복합체를 형..

구조각각의 tRNA는 서열과 길이가 다르지만 공통적으로 3'-end에 5'-CCA-3' 서열을 갖는다. A의 3'-OH에 아미노산이 공유결합한다. 안티코돈(anticodon)이 존재하여 mRNA의 특정 코돈과 상보적인 수소결합을 형성한다.→ tRNA의 일부 염기는 메틸화, 탈아미노화, 환원반응에 의해 변형되어 RNA 가수분해 효소에 의한 분해를 방지한다.아미노아실-tRNA 합성아미노아실-tRNA 합성효소(aminoacyl-tRNA synthetase)는 tRNA 3'-end의 A의 3'-OH기와 아미노산의 -COOH기 사이의 공유 결합을 형성하게 하며, 이 과정에서 ATP가 AMP와 PPi로 분해되어 에너지로 이용한다.tRNA의 특이성 실험방사선을 이용한 mischarged 실험Ala-tRNAcys를 세..

원핵세포와 진핵세포의 리보솜 비교원핵세포 - 70s 리보솜50s 큰 소단위체 : 5s rRNA + 23s rRNA + 단백질30s 작은 소단위체 : 16s rRNA + 단백질진핵세포 - 80s 리보솜60s 큰 소단위체 : 5s rRNA + 5.8s rRNA +28s rRNA + 단백질40s 작은 소단위체 : 18s rRNA + 단백질리보솜의 결합 부위30s 작은 소단위체는 SD 서열과 상보적인 수소결합을 하여 개시 코돈을 찾는데 도움을 준다.tRNA 결합부위A site : 아미노아실 부위 - 작은 소단위체와 큰 소단위체에 걸쳐서 존재P site : 펩티딜 부위 - 작은 소단위체와 큰 소단위체에 걸쳐서 존재E site : 출구 - 큰 소단위체에 한정되어 존재최초의 아미노아실-tRNA(aminoacyl-tR..

세균의 mRNA 특징하나 이상의 암호화 서열을 가지는 오페론(operon)이라는 전사 단위를 가짐 → 암호서열인 시스트론(cistion)을 가지며, 하나의 mRNA에 여러 개의 시스트론이 존재하는 polycistron이다.intron이 없고, 5'-cap, poly-A-tail이 없다.개시 코돈인 AUG 코돈이 인식되기 위한 특이적인 서열인 shine-dalgarno sequence(SD 서열)가 존재한다.SD 서열은 각 시스트론 앞( -8 ~ -13 부근)에 존재하며, 16s rRNA와 상보적인 염기쌍을 만들어 AUG를 30s 소단위가 정확히 찾도록 유도한다.진핵세포의 mRNA 특징하나의 mRNA 하나의 단백질을 암호화하는 monocistron이다.분리된 암호화 부위인 exon과 그 사이 서열인 int..