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목록생물학 임용노트/분자생물학 (66)
숭늉의 연구일지
T4 - "DNA 대사"타이민이 없는 배지에서 복제가 가능하다. 여러 핵산 대사 효소를 갖고 있다.G와 염기쌍을 형성하는 C 대신 HMC(5-hydroxymethyl cytosine)을 갖는다.T4는 DNA 상 C를 인식하고 공격하는 nucelease를 갖고 있어, HMC는 이런 효소로부터 자신의 DNA를 보호한다.대장균은 HMC를 인식하여 분해하는 endonuclease를 갖고 있다.DNA 포장 시 잘리는 위치는 특정 서열이 아닌 포장된 크기에 따라 달라진다. 이를 headful mechanism이라고 한다.포장되는 DNA는 하나의 파지에서 양 말단의 서열이 동일하다. - 말단부 중복하지만 각 파지에서 이러한 말단부 서열은 다르다. - 순환적 치환 T7 - "전사 단계 조절"DNA 구조** 숫자는 전사..
Bacterio phage : 박테리아를 숙주로 바이러스. 세균 내에서만 증식이 가능하고, 별도로 존재 가능하다. 이들은 숙주의 리보솜, 단백질 합성인자, 아미노산, 에너지 생산 시스템을 이용한다.생존에 필요한 최소 기능핵산 변형 물질 차단자신의 핵산을 박테리아를 주입감염된 세균을 다량의 파지를 생산하는 시스템으로 전환감염 세균에서 자손 파지 방출유전 물질가장 보편적으로 이중나선 DNA를 가지며, 원형 DNA, 외가닥 원형 DNA, RNA 등 다양한 방식으로 존재한다.유전 물질의 분자량도 종간에 큰 차이가 있고 클수록 더 많은 유전자를 갖고 복잡한 생활사가 가능하다.기본 구조유전 물질과 단백질 외피로 구성된다.꼬리의 유무 : 꼬리가 있음 or 꼬리가 없음단백질 외피 - capsid의 형태 : 정이십면체 ..
F 인자F plasmid의 기능을 가지기 위한 요소를 포함한다.복제 조절 요소 : ori.v(복제 원점), inc, rep전달이 시작되는 위치 - ori.T(전달 원점)전달과 관련된 유전자군 - tra operon염색체의 삽입, 절제 과정을 조절 - IS2, IS3접합Ledurberg & tatum 실험Y10 균주 - thr- leu- thi- bio+ phe+ Cys+Y2 균주 - thr+ leu+ thi+ bio- phe- Cys-→ 두 균주를 섞어주자 최소 배지에서 야생형 균주가 자라기 시작함"유전자의 전달과 재조합이 일어난다." 같은 균주를 필터를 가운데 놓고 U자관 양쪽에 첨가 시 재조합이 일어나지 않음→ "세균의 유전자 재조합에 물리적 접촉이 필요하다."F+ cell과 F- cell접합에서 유..
세균의 연구 기법탄소원, 질소, 인, 비타민, 이온, 영양물질이 존재하는 배지에 배양한다.야생형(원영양성, wild type) - 단순한 성분으로 생장, 생식에 필요한 모든 성분을 합성함. 최소 배지에서 생장이 가능하다.영양 요구성 - 대사에 필수적인 하나 이상의 효소가 결핍된 것. 최소 배지에서 생장이 불가능하다.세균을 배지에서 배양하면 세균의 생장과 분열로 유전적으로 동일한 세포 덩어리인 colony를 형성한다. 단일 colony에서 세균을 모아서 옮기면 유전적으로 순수한 세균 균주를 획득 가능하다.세균의 유전체단일 DNA - 수백만 염기쌍이 존재플라스미드(plasmid) - 세균 DNA 외에 가지는 원형의 작은 DNA 분자1~2개 존재하는 것부터 수십 개의 복사본까지 다양함세균이 살아가는데 필수적인..
전이 과정F-plasmid 사이에서 이동이 일어나는 사실을 이용하여 항생제 저항 유전자 같은 유전자의 이동을 관찰한다.복제성 전이두 플라스미드가 nick 형성 후 자유 말단이 연결되고 전사되어 co-integrate 형성 후에 res site에 재조합이 일어난다.보존적 전이전이 효소가 ITR을 전단 후 삽입하는 기작으로 복제는 일어나지 않는다. 복제성 전이 과정 중 공여 DNA에 nick이 하나 더 생겨 절단된다. 전이의 빈도 조절전이 효소 mRNA의 번역 수준은 매우 낮다.DNA 메틸화 효소에 의해 메틸화시 전사는 억제된다. - 복제 직후로 전사 시기가 제한된다.Transposon 실례옥수수의 As와 Ds 구조옥수수의 알갱이에 색소 축적을 억제하는 CI 유전자와 그 대립 열성 유전자 C와 순종끼리 교배..
개요특정 DNA 서열 단위로 한 위치에서 다른 위치로 이동 또는 전이되는 요소들은 전이인자 혹은 tranposon이라고 한다. 박테리아에서 이러한 삽입 서열을 insertion sequence라고 한다.IS(삽입 서열)구조와 특징수 백 bp ~ 수천 bp로 구성되어 있다.한 위치에서 다른 위칠 전이가 일어난다.promoter와 전이효소(tranposase)를 암호화하고 있다.거의 완벽한 ITR(말단 역반복서열, inverted terminal repeat)을 가지고 있다.transposase는 DNA 결합 단백질로 IS 서열의 ITR을 인식하여 전이 과정을 수행한다.삽입된 IS 서열의 양 말단은 정반복 서열(direct repeat)을 만든다. 대략 3~13bp 정도이다.복합 전이인자(composite ..
개요DNA는 정보를 본래 상태로 유지하기 위해 손상되거나 변화하는 부분을 본래 상태로 되돌리는 기작이 있다.하지만 모든 생물의 생식 세포와 체세포가 수용할 수 있을 정도로는 돌연변이를 유지하는데, 이는 진화의 원동력을 제공한다.일반적인 과정 : 손상 부위 인식 → endonuclease에 의한 nick 형성 → exonuclease로 손상 부위 제거 → DNA pol에 의한 합성 → DNA ligase로 연결종류mismatch repairDNA pol의 proofreading 만으로 수복되지 않는 것을 수복하는 기작이다. 99%~99.9% 까지 수복이 이루어진다.주형 가닥과 신생가닥의 구분 : 5'-GATC-3' 염기서열의 메틸화로 가능하다. Dam 메틸화 효소에 의해 5'-GATC-3' 서열의 A가 메..
이수성(aneuploidy) 돌연변이염색체 수가 2n-1, 2n+1, 2n+2와 같이 되는 경우를 말한다. 하나 또는 일부에서 염색체 비분리 현상이 일어나기 때문에 생기며, 유전적 불균형으로 생육이 빈약하고 불임률이 높다.이수성 돌연변이 예시2n+1(상염색체)21번 x 3 - 다운 증후군 / 정신 박약, 불임18번 x 3 - 에드워드 증후군 / 높은 치사율13번 x 3 - 파타우 증후군 / 심한 정신 박약2n-1(상염색체)21번 x 1 - 치사성염색체 이수성 돌연변이Y염색체 1개 + X염색체가 2개 이상 - 클라인펠터 증후군 / 낮은 지능, 불임XO(X염색체만 1개) - 터너 증후군 / 2차 성징 안 나타남, 바소체 없음XXX - 초자성 / 바소체 2개, 정신 결함, 가임XYY - 초남성 / 키가 큰 편..