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목록생물학 임용노트/분자생물학 (66)
숭늉의 연구일지
CRCs(chromatin remodeling complexes)ATP를 가수분해하여 뉴클레오솜의 구조를 변형시킨다. 이를 통해 뉴클레오솜의 와해와 복원이 일어날 수 있다.히스톤의 메틸화, 아세틸화/탈아세틸화, 인산화, 유비퀴틴화아세틸화 : HAT(히스톤 아세틸기 전이효소)는 히스톤의 풍부한 Lys 잔기에 아세틸기를 첨가시켜 DNA의 뉴클레오솜 친화성을 감소시켜 뉴클레오솜을 와해시킨다. 이를 통해 유전자 발현을 촉진한다.탈아세틸화 : 히스톤 탈아세틸화 효소에 의해 염색질의 전사를 불활성화 시킨다.메틸화 : 유전자 침묵과 X 염색체 불활성에 관여한다. HMTase가 촉매 한다.인산화 : H2A 꼬리의 인산화는 염색질 응축에 관여하는 콘덴신의 결합신호가 된다.유비퀴틴화 : 히스톤 분해의 신호가 된다.
암수 간의 X 연관 유전자의 양적 보정XX/XY, XX/XO 성 결정 체계에서 X 연관 유전자의 활성을 균일하게 하는 것 포유류 - 암컷의 두 개의 X 염색체 중 하나만 무작위적으로 응축되어 불활성화된다. 이를 라이온 효과라고 한다. 이때 응축된 X 염색체를 바소체(bar body)라고 한다. 초파리 - 수컷의 X 염색체가 과활성화(hyper activation)되어 유전자 활성을 바로 증가시킨다. 이 과정에서 Sx1 유전자가 관여한다. 이 유전자가 발현되는 경우 암컷에서 과발현이 일어난다. 이 유전자가 발현되지 않는 경우 수컷에서 과발현이 일어난다. 예쁜 꼬마 선충 - XX를 갖는 개체는 두 개의 X염색체가 과소활성화 된다. 포유류 암컷의 X 염색체 불활성화XIC(X 불활성화 중심)에서 시작되어 양 방..
이질 염색질과 진정 염색질용어 원문 정리 : 이질 염색질(heterochromatin), 진정 염색질(euchromatin)기능적인 관점에서 대부분의 유전자는 진정 염색질에 존재한다. 반면, 이질 염색질에는 거의 존재하지 않는다. 이질 염색질이 전사 시스템의 접근이 힘든 상태로 응축되어 있기 때문이다. DNaseⅠ의 고감수성 부위는 일반적으로 활발히 전사되는 유전자이다. 이 유전자들의 DNA는 풀려있는 상태이다. 이러한 민감도는 비히스톤 단백질인 HMG14/17에 의해 생긴다. 만일 이 단백질을 제거하는 경우 DNaseⅠ의 민감도는 사라진다.솔 염색체와 다사 염색체용어 원문 정리 : 솔 염색체(lampbrush chromosome), 다사 염색체(polytene chromosome)양서류 난자의 염색체인..
진핵 생물의 유전자 발현 개요원핵생물과 달리 진핵 생물은 유전자 발현 조절에 몇 가지 특징을 갖는다.전사와 번역이 시공간적으로 분리되어 있다.RNA pol의 접근이 chromatin의 구조에 의해 제한된다. → 구조의 변화와 관련되어 있다.양성 조절이 우세하다.전형적으로 monocistron이며, intron이 존재한다.복합한 다중체 조절 단백질을 가진다.
L-아라비노스(L-arabinose)를 탄소원으로 사용하게 하는 대사를 조절한다.구조2개의 operator - ara O1, ara O2ara PBAD - 구조 유전자의 프로모터ara PC - 조절 유전자의 프로모터ara C - 조절 유전자조절기작Ara C 단백질에 의한 ara C 유전자 자가 조절Ara C 단백질 고갈 시 ara O1에 Ara C 단백질이 결합되지 않아서 RNA pol이 PC에 결합되어 ara C 유전자가 전사된다.Ara C 단백질이 세포 내에 존재 시 ara O1에 Ara C가 결합하여 ara C 유전자가 전사되지 못한다.포도당의 농도가 높고, 아라비노스 농도가 낮을 때(혹은 없을 때)Ara C 단백질이 ara O2와 ara Ⅰ의 절반에 결합하여 이량체를 형성하여 DNA 고리 구조를 ..
구조트립토판을 합성하는 효소를 암호화하고 있다.Trp repressor는 trp 오페론과 떨어져 존재한다.operator는 1차 프로모터 내에 존재하고 있다.Leader RNA(선도 RNA) 지역이 존재(trpL)하며, trp 농도에 따라 전사를 조절한다.Leader RNA선도 폴리펩타이드 지역(LP) : AUG~UGA 번역틀 내에 14개의 아미노산을 암호화하고 있으며, 10번째와 11번째 아미노산이 trp이다.감쇠서열(trpa) : 선도 서열 내에 1~4까지 hairpin 구조를 형성할 수 있는 서열이 존재한다. 1-2, 2-3, 3-4의 형태로 hairpin을 형성하는 것이 가능하다.ON/OFF 조절 매커니즘ON/OFF 조절 메커니즘 크게 2가지가 존재한다.억제자(repressor)에 의한 조절Trp..
Lac operon의 조절구조 유전자 : 운반과 대사에 필요한 산물을 암호화조절 유전자 : 오페론 조절에 관여하는 유전자lacZ, lacY, lacA가 polycistronic mRNA내에 암호화되며 각 cistron이 자신의 리보솜 결합 자리가 존재한다.promoter와 operator는 근접해서 위치하며, RNA pol은 프로모터와 결합하여 유전자를 mRNA 분자로 전사한다.lacI는 항상 발현되어 repressor를 만들고 operator와 결합하여 전사를 억제한다.effector는 repressor에 결합 후 depression 과정을 일으켜 전사를 촉진한다.이화 대사산물 억제CAP 단백질(cabolite activator protein)과 CAP 단백질의 effector인 cAMP에 의해 매개된..
구성성 돌연변이 실험 1유도체 존재 시와 비존재 시 모두 lac mRNA를 생성하는 경우 '상시적으로 발현된다고' 하며, 돌연변이를 통해 구성성 돌연변이를 얻어서 실험을 실시한다. I+ O+ lacZ+ : 유도성을 나타냄I- O+ lacZ+ : 구성성을 나타냄→ lac I는 조절 유전자이며, effector가 없을 때 조절 시스템을 꺼버린다. F' I- O+ lacZ+ / I+ O+ lacZ+/-F' I+ O+ lacZ+ / I- O+ lacZ+위의 경우는 둘 다 유도성을 나타냄→ lac I 유전자 산물은 확산되는 속성을 가지며, lac I는 조절 유전자이며, 산물은 repressor이다. lac I자신의 프로모터를 따로 가지며 작동 유전자와는 독립적으로 작용한다.발현 산물은 repressor이며, 4량..