숭늉의 연구일지

mRNA 안정성 조절mRNA의 수명은 번역량을 결정한다. 대표적으로 mRNA 수명에 영향을 주는 요인은 2가지이다.poly-A-tail : mRNA를 안정화한다. 존재 시 번역이 지속되나 어느 정도 짧아지면 빠르게 된다.3'-UTR : 서열 내에서 AUUUA 서열 존재시 불안정해진다.환경 요인 온도 : 고온 스트레스시 열-충격 단백질의 합성이 촉진된다. 예> 초파리 - 고온 환경에서 HSTF(열 충격인자)의 인산화로 hsp70의 발현을 촉진한다. 빛 : 식물의 광색소인 파이토크롬(phytochrome)에 영향을 받는 핵 단백질 rbcs가 있다. 호르몬 번역 조절 성숙 mRNA(mature-mRNA)는 수정 초기에 단백질-RNA 복합체 형태로 안정하게 보관되어 조건 변화 시 이용한다. chemical이나 ..

Alternative processing(선택적 프로세싱)mRNA processing 과정에서 절단과 폴리아데닐화가 다양하게 일어나거나 splicing이 다양해지면 동일한 초기 RNA에서 서로 다른 mRNA가 생성될 수 있다. 예시> pre-mRNA : 5' - ABCDD'FF'(R)GH - 3' (엑손만 표현 () 내부는 인트론) 프로세싱 1 - 5' - ABCDEFG - 3' (기존) 프로세싱 2 - 5' - BDEFF'RGH- 3' (선택적 프로세싱) 선택적 프로세싱 기작 예시전사가 대체 프로모터에서 시작다른 엑손이 제거 (C가 제거)대체 5' splicing (DD')대체 3' splicing (FF')인트론으로 인식하지 않음 - R(retained intron) → intron이 삽입된 mRNA..

enhancer전사 개시율을 상승시킨다. 여러 종류의 단백질들이 복합체를 형성하여 결합한다. 위치는 상관없고 DNA 서열에 대한 특이성을 위해 복합체를 형성한다.DNA bending을 형성하여 매개자를 통하거나 직접 Transcription factor(TF)에 결합하여 프로모터를 활성화한다. 이로 인해 RNA pol의 프로모터 결합을 촉진한다. 이때 HMG(비히스톤성 DNA 결합 단백질)가 bending을 촉진한다.Transcript activator(TA)DNA와 결합하는 DNA binding domain과 전사 개시율을 증가시키는 activator domain으로 구성되며, 두 domain은 독립적으로 기능되고 분리되어 있다.RNA polymerase complex와 general transcrip..

CRCs(chromatin remodeling complexes)ATP를 가수분해하여 뉴클레오솜의 구조를 변형시킨다. 이를 통해 뉴클레오솜의 와해와 복원이 일어날 수 있다.히스톤의 메틸화, 아세틸화/탈아세틸화, 인산화, 유비퀴틴화아세틸화 : HAT(히스톤 아세틸기 전이효소)는 히스톤의 풍부한 Lys 잔기에 아세틸기를 첨가시켜 DNA의 뉴클레오솜 친화성을 감소시켜 뉴클레오솜을 와해시킨다. 이를 통해 유전자 발현을 촉진한다.탈아세틸화 : 히스톤 탈아세틸화 효소에 의해 염색질의 전사를 불활성화 시킨다.메틸화 : 유전자 침묵과 X 염색체 불활성에 관여한다. HMTase가 촉매 한다.인산화 : H2A 꼬리의 인산화는 염색질 응축에 관여하는 콘덴신의 결합신호가 된다.유비퀴틴화 : 히스톤 분해의 신호가 된다.

암수 간의 X 연관 유전자의 양적 보정XX/XY, XX/XO 성 결정 체계에서 X 연관 유전자의 활성을 균일하게 하는 것 포유류 - 암컷의 두 개의 X 염색체 중 하나만 무작위적으로 응축되어 불활성화된다. 이를 라이온 효과라고 한다. 이때 응축된 X 염색체를 바소체(bar body)라고 한다. 초파리 - 수컷의 X 염색체가 과활성화(hyper activation)되어 유전자 활성을 바로 증가시킨다. 이 과정에서 Sx1 유전자가 관여한다. 이 유전자가 발현되는 경우 암컷에서 과발현이 일어난다. 이 유전자가 발현되지 않는 경우 수컷에서 과발현이 일어난다. 예쁜 꼬마 선충 - XX를 갖는 개체는 두 개의 X염색체가 과소활성화 된다. 포유류 암컷의 X 염색체 불활성화XIC(X 불활성화 중심)에서 시작되어 양 방..

이질 염색질과 진정 염색질용어 원문 정리 : 이질 염색질(heterochromatin), 진정 염색질(euchromatin)기능적인 관점에서 대부분의 유전자는 진정 염색질에 존재한다. 반면, 이질 염색질에는 거의 존재하지 않는다. 이질 염색질이 전사 시스템의 접근이 힘든 상태로 응축되어 있기 때문이다. DNaseⅠ의 고감수성 부위는 일반적으로 활발히 전사되는 유전자이다. 이 유전자들의 DNA는 풀려있는 상태이다. 이러한 민감도는 비히스톤 단백질인 HMG14/17에 의해 생긴다. 만일 이 단백질을 제거하는 경우 DNaseⅠ의 민감도는 사라진다.솔 염색체와 다사 염색체용어 원문 정리 : 솔 염색체(lampbrush chromosome), 다사 염색체(polytene chromosome)양서류 난자의 염색체인..

진핵 생물의 유전자 발현 개요원핵생물과 달리 진핵 생물은 유전자 발현 조절에 몇 가지 특징을 갖는다.전사와 번역이 시공간적으로 분리되어 있다.RNA pol의 접근이 chromatin의 구조에 의해 제한된다. → 구조의 변화와 관련되어 있다.양성 조절이 우세하다.전형적으로 monocistron이며, intron이 존재한다.복합한 다중체 조절 단백질을 가진다.