숭늉의 연구일지

F 플라스미드를 갖는 박테리아를 통해 유전적 실험을 수행한다,F' 플라스미드를 가진 박테리아가 다른 박테리아로 전달 시 유전자를 확보한다.→ recipent(수혜자) 박테리아는 2개의 유전자를 갖는 부분 이배체 상태가 된다.Lactose를 이용하지 않고 돌연변이 종을 분리F 플라스미드가 없는 것과 있는 것을 교배 후 분리한다.F' lacY- lacZ+ / lacY+ lacZ-, F' lacY+ lacZ- / lacY- lacZ+ → Lac+ 표현형F' lacY- lacZ+ / lacY- lacZ-, F' lacY+ lacZ- / lacY+ lacZ- → Lac- 표현형"Lactose 이용 시스템은 적어도 lacZ와 lacY로 구성되며 두 유전자가 전부 기능을 해야 한다."Lactose 이용 가능 여부 실..

RBS(regulator binding site)조절 유전자 산물이 결합하여 기능을 수행하는 곳으로 활성인자나 억제인자가 결합한다. 특히 세균에서 억제인자 결합 부위를 operator라고 한다.effector(효과 인자)조절 단백질에 결합하여 활성을 촉진 또는 억제하는 물질이다.inducer : 유전자 발현을 유도하는데 관여하는 효과인자corepressor : 유전자 발현 억제에 관여하는 효과인자coactivator : 활성인자에 결합하여 전사가 개시되도록 하는 단백질(진핵생물)opreron(오페론)구조 유전자, 조절 단백질 결합자리, 프로모터를 포함하는 완전한 연속적 단위로서 한 대사에 참여하는 단백질을 연합적으로 조절한다. 실무율 법칙이 적용된다.→ 여러 개의 구조 유전자가 polycistron 상태..

유전자 발현 조절의 기초다세포 생물의 서로 다른 유형의 세포는 동일한 DNA를 갖는다. 따라서 하나의 생물체에서 다양한 종류의 세포가 나타나는 이유는 유전자 발현이 서로 다르기 때문이다.물질의 합성 효율 측면에서 물질의 합성 능력이 필요한 시기에만 수행될 경우에는 경제적이고, 적응 측면에서 타당성을 보인다. → 일반적으로 이러한 물질의 합성 조절은 유전자 조절에 의해 일어난다.원핵생물은 성장이 해로울 때를 제외하고, 특정 환경에서 최대 성장률이 되도록 적응한다.진핵생물은 복잡한 발현 조절로, 적응, 변ㅇ이, 분화 및 발생이 되도록 적응한다.mRNA, 단백질의 합성을 통제하여 전사율, 번역율을 조절하거나 발현하는 데 있어 ON / OFF 조절을 통해 필요시에만 발현한다.조절 단계유전자 발현 조절 단계는 여..

종결종결 코돈인 UAA, UAG, UGA 중 하나를 만날 때 일어난다. 이들과 상보적인 수소결합을 형성하는 tRNA가 존재하지 않으며, 대신에 방출인자(RF)가 정지 코돈에 결합하여 폴리펩타이드 C말단에 물 분자를 첨가하게 한다. 이 과정에 peptidyl transferase가 작용한다. 이후 리보솜은 폴리펩타이드와 mRNA를 방출하고 리보솜은 분리된다.세균은 RF1, RF2, RF3를 갖는다.진핵세포는 eRF를 갖는다.번역 저해 물질세균, 진핵세포 공통 저해 물질퓨로마이신(puromycin) :  아미노아실-tRNA와 유사한 구조이다. 대신에 A 자리에 삽입되어 번역을 중단시킨다.리신(ricin) : 진핵세포 리보솜의 60s 소단위체를 불활성화시킨다. 세균의 23 rRNA의 탈퓨린화를 일으킨다.세균 ..

신장(elongation)아미노아실-tRNA가 GTP와 결합되어 있는 신장 인자(Elongation factor)인 EF-Tu와 결합하여 복합체를 만들고, 70s 개시 전 복합체의 A 부위에 결합하면서 GTP가 가수분해 되어 EF-Tu와 GDP 복합체가 떨어져 나간다. 이후 EF-Ts에 의해 GDP는 해리되고 GTP가 결합하여 재생한다.  A site와 P site에 위치하는 tRNA 간의 펩타이드 결합은 50s 리보솜의 23s rRNA의 peptidyltransferase에 의해 촉매 된다. 개시 tRNA의 아미노산이 A site에서 tRNA로 전이된다. 리보솜이 mRNA 3'-end 쪽으로 한 코돈씩 이동한다. A site의 펩티딜-tRNA를 P site로 이동시키고 탈아실화된 tRNA를 P site..

개요개시, 신장, 종결 3단계로 구분된다.코돈과 새로 들어온 아미노아실-tRNA가 상보적으로 결합하여 A site에 결합한다.큰 소단위체가 자리를 이동한다.작은 소단위체가 mRNA 분자를 따라 3NT 이동 후 tRNA가 떨어져 나간다.개시(원핵생물 중심)30s 소단위체가 initiation factor인 IF-1, IF-3와 결합한다.IF-1 : tRNA의 A site 조기 결합을 억제한다. 또한 70s 복합체를 50s와 30s로 분리시키는 것도 수행한다.IF-3 : 50s 소단위체 결합을 억제한다.이후 mRNA에 30s 소단위체가 결합한다. 이때 16s rRNA가 SD 서열과 상보적 수소결합을 한다.1의 복합체에 fMet-tRNAfMet과 GTP가 결합된 IF-2가 결합하여 30s 개시 전 복합체를 형..

구조각각의 tRNA는 서열과 길이가 다르지만 공통적으로 3'-end에 5'-CCA-3' 서열을 갖는다. A의 3'-OH에 아미노산이 공유결합한다. 안티코돈(anticodon)이 존재하여 mRNA의 특정 코돈과 상보적인 수소결합을 형성한다.→ tRNA의 일부 염기는 메틸화, 탈아미노화, 환원반응에 의해 변형되어 RNA 가수분해 효소에 의한 분해를 방지한다.아미노아실-tRNA 합성아미노아실-tRNA 합성효소(aminoacyl-tRNA synthetase)는 tRNA 3'-end의 A의 3'-OH기와 아미노산의 -COOH기 사이의 공유 결합을 형성하게 하며, 이 과정에서 ATP가 AMP와 PPi로 분해되어 에너지로 이용한다.tRNA의 특이성 실험방사선을 이용한 mischarged 실험Ala-tRNAcys를 세..

원핵세포와 진핵세포의 리보솜 비교원핵세포 - 70s 리보솜50s 큰 소단위체 : 5s rRNA + 23s rRNA + 단백질30s 작은 소단위체 : 16s rRNA + 단백질진핵세포 - 80s 리보솜60s 큰 소단위체 : 5s rRNA + 5.8s rRNA +28s rRNA + 단백질40s 작은 소단위체 : 18s rRNA + 단백질리보솜의 결합 부위30s 작은 소단위체는 SD 서열과 상보적인 수소결합을 하여 개시 코돈을 찾는데 도움을 준다.tRNA 결합부위A site : 아미노아실 부위 - 작은 소단위체와 큰 소단위체에 걸쳐서 존재P site : 펩티딜 부위 - 작은 소단위체와 큰 소단위체에 걸쳐서 존재E site : 출구 - 큰 소단위체에 한정되어 존재최초의 아미노아실-tRNA(aminoacyl-tR..