숭늉의 연구일지

변성열과 극단의 pH는 DNA에서 이중 나선의 융해(melting) 또는 변성(denaturation)을 일으킨다. 이때 염기쌍의 수소 결합이 풀려 두 가닥의 DNA 사슬이 완전히 혹은 부분적으로 분리된 상태가 된다. 하지만 DNA를 구성하는 공유 결합을 끊어지지 않는다.융해 온도(Tm)열을 가해 DNA를 변성시킬 때 DNA의 절반이 변성되었을 때의 온도를 융해온도(Tm)라고 한다. 일반적으로,DNA의 길이가 길 수록 결합력이 강해져 Tm이 높아진다.DNA를 구성한 G-C 비율이 높을수록 결합력이 강해져 Tm이 높아진다.DNA 변성 요인DNA 변성 요인에는 고온, 극단의 pH, 낮은 염농도, 디메틸 황산, 요소(urea), 포름 아마이드, helicase 등이 있다. 1. 높은 pH는 양성자를 제거해 수..

기능mRNA : 전사 과정에 의해 만들어지며 핵으로부터 세포질로 유전 정보를 운반한다.monocistron : 하나의 mRNA 분자에 1개의 폴리펩타이드를 암호화하고 있음polycistron : 하나의 mRNA 분자에 2개 이상의 폴리펩타이드를 암호화하고 있음tRNA : 연장되고 있는 폴리펩타이드에 올바른 서열로 아미노산이 전달되도록 중개하는 역할을 한다.rRNA : 리보솜의 구성 성분이다.ribozyme : 효소적 기능을 하고 있는 RNA이다.3차원적 구조단순한 1차원적인 서열의 형태로 존재하기도 하지만 상보적 서열을 통해 여러 구조를 형성하는 것이 가능하다.1. 돌출부(bulge) : 잘 못 짝지어지거나, 짝지어지지 않은 염기가 존재할 때 나타난다.2. 내부 루프(internal loop)3. 헤어핀..

원형 DNA(circular DNA)5'-end와 3'-end가 공유 결합한 상태로 자기 자신의 DNA 말단들이 서로 공유 결합 되어 두 환의 사슬이 서로 꼬여 있는 형태의 DNA를 말한다.초나선 DNA환형 구조의 DNA 꼬임이 1~2개 더 들어간 상태 또는 덜 들어간 상태이다. 아무런 꼬임이 없는 원형 DNA와 위상이성질체(topoisomer)이다.Tw(비틀림 수), Wr(꼬임수), Lk(고리수)초나선 DNA에서는 3가지 값을 사용한다. Tw(비틀림 수) : DNA 이중 가닥 내에서 꼬인 정도를 말한다. Wr(꼬임수) : DNA 이중 가닥 사이의 꼬인 정도를 말한다.Lk(고리수) : 비틀림 수와 꼬임수의 합을 말한다.Lk = Tw+ Wr = DNA 전체의 bp / 평균 1회전당 bp Wr의 경우 Lk를..

DNA의 3차원 형태DNA는 매우 유연한 분자이다.당-인산기 골격 위주로 회전이 가능하고 열에 의한 휨, 신장, 융해 등이 일어난다.하지만 이런 유연성에도 상보성과 역평행과 같은 특성은 유지된다. DNA 구조 변이의 이유1. 오탄당의 다른 형태(이성질체)2. 인산기의 회전3. 염기의 회전 하지만 입체 장애에 의해 퓨린 잔기는 syn와 anti 2가지의 형태만, 피리미딘 잔기는 anti 형태로만 존재한다. B-DNA, A-DNA, Z-DNA1. B-DNA생리학적 조건에서 가장 안정한 형태우회전성, 1회전당 10.5bp, 3.4nm, 직경 2nm큰 고랑(major groove)**과 작은 고랑(minor groove)이 존재** 여기서 Major groove는 DNA binding protein이 붙는 자리..

DNA의 특이적 구조의 원인DNA의 특이적 구조는 Bending과 회문(palindrome) 구조에 의한 hairpin, cruci form 형성이 있다.Bending한 가닥에 아데노신(A) 잔기가 4개 이상 나타날 경우 Bending이 생길 수 있다. 연속되는 6개의 아데노신은 18º의 bending을 만들어낼 수 있다.회문(palindrome)DNA에서 두 가닥에 걸쳐 두 방향의 대칭성을 가지며 역반복서열이 나타나는 DNA 부분을 말한다.→ 각각 가닥 내에서 자체적으로 상보적이어서 hairpin 구조, cruci form을 형성 할 수 있다.만일 DNA 각 서열에 역반복 서열이 나타나는 경우는 거울상 반복이라고 한다. 이 경우는 상보적 서열이 없어 hairpin 구조, cruci form을 형성하지 ..

DNA의 구조의 발견Chargaff의 법칙 : DNA를 이루는 피리미딘 잔기의 합은 퓨린 잔기의 합과 같다. 즉 A + G = C + T이다.Franklin & Willkins : DNA X선 회절 사진을 통해 나선의 구조를 예측함 → '이중 나선 or 삼중 나선 일 것이다.'Watson & Crick : 이를 바탕으로 DNA의 3차원적 구조 모형을 고안DNA의 구조이중 나선디옥시리보스와 인산기가 교대로 나열된 친수성 골격이 이중 나선 외측에서 물과 접한다.염기는 이중나선 내부에서 차곡차곡 쌓여 있고 장축에 수직으로 배열되어 있다.→ 큰 고랑(major groove)과 작은 고랑(minor groove)이 나타난다.상보성이중 나선 DNA의 각 폴리뉴클레오타이드 사슬은 염기 서열과 조성이 같지 않고 상보적..

핵산의 결합DNA와 RNA의 연속된 뉴클레오타이드는 인산기 '다리(bridge)'에 의해 공유 결합으로 연결되어 있다.첫 번째 뉴클레오타이드의 5'-인산기가 다음 뉴클레오타이드의 3'-하이드록시기에 연결되어 인산 다이에스터 결합(phosphodiester linkage)을 형성한다.인산기와 오탄당 잔기가 번갈아 공유결합되어 있다. 이들은 pH7.0에서 완전히 이온화하여 음전하를 띠고 있으나 금속이온이나 단백질(예> 히스톤)들에 의해 중화된다.질소 염기는 골격에 일정한 간격으로 결합된 곁사슬의 형태로 존재한다.각 핵산 가닥에 극성을 부여하여 5'-end와 3'-end를 구별한다.5'-end : 5' 위치에 뉴클레오타이드가 없는 부위3'-end : 3' 위치에 뉴클레오타이드가 없는 부위NTP(ATP, CTP..

뉴클레오타이드(nucleotide)에너지 화폐, 호르몬, 화학적 연결자, 효소의 보조인자, 대사의 중간물로 사용되는 물질가장 중요한 기능은 DNA(deoyribonucleic acid), RNA(ribonucleic acid)와 같은 핵산을 구성하는 구성성분구성성분뉴클레오타이드는 질소 염기(nitrogen base) + 오탄당(pentose) + 인산염(phosphate)으로 구성된다.뉴클레오타이드에서 인산기가 없는 것을 뉴클레오시드(nucleoside)라고 한다.오탄당 고리의 1' 탄소와 N-β-글라이코시드 결합에 의해 염기가 공유결합 되어 있다.인산염은 5' 탄소와 에스터 결합을 통해 연결되어 있다. 염기(base)두 종류의 모체 화합물인 피리미딘(pyrimidine)과 퓨린(purine) 유도체이다..