숭늉의 연구일지

활성과 기능5' → 3' 중합 활성미리 존재하는 핵산 가닥의 3'-OH 말단에 dNTP 단량체를 중합시킨다. 하지만 두 dNTP 단량체 간 중합 활성은 없다.RNA primer가 필요 - primase(DNA G protein)이 합성해줌이중가닥이 풀려야 함 - helicase와 topoisomerase가 해결5' → 3' 방향만 활성을 가짐 - 선도가닥(leading strand)과 지연 가닥(lagging strand)이 생김외가닥 DNA 상태를 유지해야 함 - SSB가 해결 3' → 5' exonucelease 활성올바르지 않은 염기의 삽입에 의해 생기는 비틀림은 proofreading 기작에 의해 올바르게 교정된다.→ exonuclease 작용 + 중합 작용이 과정에서 107개당 1개까지 오류 수..

반보존적 복제양친의 DNA 이중나선이 두 가닥으로 분리되고 이 가닥들이 각각 새로 합성될 가닥의 주형으로 작용한다는 것.Meselson  & Stahl의 증명 실험6M의 CsCl 용액에서 평형 밀도 구배 원심 분리 시 밀도에 따라 띠가 형성된다.(6M CsCl - 1.7g/㎤ , 14N DNA - 1.710g/㎤ , 15N DNA - 1.724g/㎤)15N 배지에서 키운 세포를 15N 제거 후 14N 배지로 옮겨 배양한 후 DNA를 분리하여 원심분리한다. 이후 이 용액에 EtBr 처리 후 자외선 하에서 관찰한다. 이때 초나선 DNA는 밀도가 더 높게 관찰되는데, 이는 EtBr이 부유 밀도를 낮추기 때문이다. 제 1세대 - 모두 14과 15N의 중간 밀도의 DNA를 가졌다. - 보존적 복제 기작 기각제 2..

염색질(chromatin)Methylene blue로 핵 내에서 염색되는 물질이다.DNA가 히스톤이라는 염기성 단백질에 결합한 것을 말한다.DNA + 히스톤 + 여러 단백질 = 염색질뉴클레오솜 단위체로 구성된다.고농도의 염을 처리 시 히스톤 + 순수 DNA로 분리가 가능하다.히스톤(histone)H1, H2A, H2B, H3, H4에서 4종류의 히스톤 단백질이 8량체(octomer)를 형성한다.Arg과 Lys이 풍부하여 산성의 DNA와 잘 결합한다.DNA와 히스톤이 결합하여 뉴클레오솜을 형성한다.히스톤은 DNA의 큰 고랑(major groove)과 결합한다.뉴클레오솜(nucleosome)H2A, H2B, H3, H4에서 4종류의 히스톤 단백질이 8량체(octomer)를 형성한 후 DNA와 결합한 것으로 ..

원핵생물의 염색체 예시> E.Coli DNA 전체 길이는 1100㎛(원형 DNA 기준)인데 세포의 직경은 1~2㎛ 정도에 불과하다. 따라서 DNA가 고도로 응축될 필요성이 있다. 따라서 DNA가 초나선을 형성하게 된다. 이런 원핵생물의 초나선 DNA에 RNase나 DNase를 처리하면 초나선이 풀리게 된다.1. RNase - RNA 연결 고리를 절단2. DNase - DNA에 nick을 형성 DNA gyrase가 원핵생물 DNA의 초나선 구조 형성에 관여하며, 1개의 scaffold당 100여 개의 초나선 고리가 존재한다.

재생변성된 DNA의 상보적 단일 가닥은 적절한 조건 하에 천천히 냉각시, 상보적 두 가닥이 수소 결합이 재형성된다.→ 생리적 조건 회복 시 위와 같이 수소 결합이 재형성되는 것을 annealing이라고 한다. DNA 분자의 재생은 12개 이상의 잔기가 두 가닥에 접합시 신속하게 재생된다.하지만 DNA가 두 가닥으로 완전히 분리된 경우 두 단계에 걸쳐 재생이 진행된다.step1 : (비교적 느림) 두 가닥의 DNA가 무작정 충돌하여 상대 가닥을 찾아 상보적 결합을 형성한다.step2 : 비교적 빠르게 진행된다. 지퍼가 잠기는 것처럼 상보적 염기쌍의 결합이 형성된다.DNA 재생 조건1. DNA간 척력 제거 - 염농도가 높아야 함(0.15~0.5M NaCl)2. 무작위 수소결합이 파괴되는 온도는 되어야 함 →..

변성열과 극단의 pH는 DNA에서 이중 나선의 융해(melting) 또는 변성(denaturation)을 일으킨다. 이때 염기쌍의 수소 결합이 풀려 두 가닥의 DNA 사슬이 완전히 혹은 부분적으로 분리된 상태가 된다. 하지만 DNA를 구성하는 공유 결합을 끊어지지 않는다.융해 온도(Tm)열을 가해 DNA를 변성시킬 때 DNA의 절반이 변성되었을 때의 온도를 융해온도(Tm)라고 한다. 일반적으로,DNA의 길이가 길 수록 결합력이 강해져 Tm이 높아진다.DNA를 구성한 G-C 비율이 높을수록 결합력이 강해져 Tm이 높아진다.DNA 변성 요인DNA 변성 요인에는 고온, 극단의 pH, 낮은 염농도, 디메틸 황산, 요소(urea), 포름 아마이드, helicase 등이 있다. 1. 높은 pH는 양성자를 제거해 수..

기능mRNA : 전사 과정에 의해 만들어지며 핵으로부터 세포질로 유전 정보를 운반한다.monocistron : 하나의 mRNA 분자에 1개의 폴리펩타이드를 암호화하고 있음polycistron : 하나의 mRNA 분자에 2개 이상의 폴리펩타이드를 암호화하고 있음tRNA : 연장되고 있는 폴리펩타이드에 올바른 서열로 아미노산이 전달되도록 중개하는 역할을 한다.rRNA : 리보솜의 구성 성분이다.ribozyme : 효소적 기능을 하고 있는 RNA이다.3차원적 구조단순한 1차원적인 서열의 형태로 존재하기도 하지만 상보적 서열을 통해 여러 구조를 형성하는 것이 가능하다.1. 돌출부(bulge) : 잘 못 짝지어지거나, 짝지어지지 않은 염기가 존재할 때 나타난다.2. 내부 루프(internal loop)3. 헤어핀..

원형 DNA(circular DNA)5'-end와 3'-end가 공유 결합한 상태로 자기 자신의 DNA 말단들이 서로 공유 결합 되어 두 환의 사슬이 서로 꼬여 있는 형태의 DNA를 말한다.초나선 DNA환형 구조의 DNA 꼬임이 1~2개 더 들어간 상태 또는 덜 들어간 상태이다. 아무런 꼬임이 없는 원형 DNA와 위상이성질체(topoisomer)이다.Tw(비틀림 수), Wr(꼬임수), Lk(고리수)초나선 DNA에서는 3가지 값을 사용한다. Tw(비틀림 수) : DNA 이중 가닥 내에서 꼬인 정도를 말한다. Wr(꼬임수) : DNA 이중 가닥 사이의 꼬인 정도를 말한다.Lk(고리수) : 비틀림 수와 꼬임수의 합을 말한다.Lk = Tw+ Wr = DNA 전체의 bp / 평균 1회전당 bp Wr의 경우 Lk를..