숭늉의 연구일지

원형 DNA(circular DNA)5'-end와 3'-end가 공유 결합한 상태로 자기 자신의 DNA 말단들이 서로 공유 결합 되어 두 환의 사슬이 서로 꼬여 있는 형태의 DNA를 말한다.초나선 DNA환형 구조의 DNA 꼬임이 1~2개 더 들어간 상태 또는 덜 들어간 상태이다. 아무런 꼬임이 없는 원형 DNA와 위상이성질체(topoisomer)이다.Tw(비틀림 수), Wr(꼬임수), Lk(고리수)초나선 DNA에서는 3가지 값을 사용한다. Tw(비틀림 수) : DNA 이중 가닥 내에서 꼬인 정도를 말한다. Wr(꼬임수) : DNA 이중 가닥 사이의 꼬인 정도를 말한다.Lk(고리수) : 비틀림 수와 꼬임수의 합을 말한다.Lk = Tw+ Wr = DNA 전체의 bp / 평균 1회전당 bp Wr의 경우 Lk를..

DNA의 3차원 형태DNA는 매우 유연한 분자이다.당-인산기 골격 위주로 회전이 가능하고 열에 의한 휨, 신장, 융해 등이 일어난다.하지만 이런 유연성에도 상보성과 역평행과 같은 특성은 유지된다. DNA 구조 변이의 이유1. 오탄당의 다른 형태(이성질체)2. 인산기의 회전3. 염기의 회전 하지만 입체 장애에 의해 퓨린 잔기는 syn와 anti 2가지의 형태만, 피리미딘 잔기는 anti 형태로만 존재한다. B-DNA, A-DNA, Z-DNA1. B-DNA생리학적 조건에서 가장 안정한 형태우회전성, 1회전당 10.5bp, 3.4nm, 직경 2nm큰 고랑(major groove)**과 작은 고랑(minor groove)이 존재** 여기서 Major groove는 DNA binding protein이 붙는 자리..

DNA의 특이적 구조의 원인DNA의 특이적 구조는 Bending과 회문(palindrome) 구조에 의한 hairpin, cruci form 형성이 있다.Bending한 가닥에 아데노신(A) 잔기가 4개 이상 나타날 경우 Bending이 생길 수 있다. 연속되는 6개의 아데노신은 18º의 bending을 만들어낼 수 있다.회문(palindrome)DNA에서 두 가닥에 걸쳐 두 방향의 대칭성을 가지며 역반복서열이 나타나는 DNA 부분을 말한다.→ 각각 가닥 내에서 자체적으로 상보적이어서 hairpin 구조, cruci form을 형성 할 수 있다.만일 DNA 각 서열에 역반복 서열이 나타나는 경우는 거울상 반복이라고 한다. 이 경우는 상보적 서열이 없어 hairpin 구조, cruci form을 형성하지 ..

DNA의 구조의 발견Chargaff의 법칙 : DNA를 이루는 피리미딘 잔기의 합은 퓨린 잔기의 합과 같다. 즉 A + G = C + T이다.Franklin & Willkins : DNA X선 회절 사진을 통해 나선의 구조를 예측함 → '이중 나선 or 삼중 나선 일 것이다.'Watson & Crick : 이를 바탕으로 DNA의 3차원적 구조 모형을 고안DNA의 구조이중 나선디옥시리보스와 인산기가 교대로 나열된 친수성 골격이 이중 나선 외측에서 물과 접한다.염기는 이중나선 내부에서 차곡차곡 쌓여 있고 장축에 수직으로 배열되어 있다.→ 큰 고랑(major groove)과 작은 고랑(minor groove)이 나타난다.상보성이중 나선 DNA의 각 폴리뉴클레오타이드 사슬은 염기 서열과 조성이 같지 않고 상보적..

핵산의 결합DNA와 RNA의 연속된 뉴클레오타이드는 인산기 '다리(bridge)'에 의해 공유 결합으로 연결되어 있다.첫 번째 뉴클레오타이드의 5'-인산기가 다음 뉴클레오타이드의 3'-하이드록시기에 연결되어 인산 다이에스터 결합(phosphodiester linkage)을 형성한다.인산기와 오탄당 잔기가 번갈아 공유결합되어 있다. 이들은 pH7.0에서 완전히 이온화하여 음전하를 띠고 있으나 금속이온이나 단백질(예> 히스톤)들에 의해 중화된다.질소 염기는 골격에 일정한 간격으로 결합된 곁사슬의 형태로 존재한다.각 핵산 가닥에 극성을 부여하여 5'-end와 3'-end를 구별한다.5'-end : 5' 위치에 뉴클레오타이드가 없는 부위3'-end : 3' 위치에 뉴클레오타이드가 없는 부위NTP(ATP, CTP..

뉴클레오타이드(nucleotide)에너지 화폐, 호르몬, 화학적 연결자, 효소의 보조인자, 대사의 중간물로 사용되는 물질가장 중요한 기능은 DNA(deoyribonucleic acid), RNA(ribonucleic acid)와 같은 핵산을 구성하는 구성성분구성성분뉴클레오타이드는 질소 염기(nitrogen base) + 오탄당(pentose) + 인산염(phosphate)으로 구성된다.뉴클레오타이드에서 인산기가 없는 것을 뉴클레오시드(nucleoside)라고 한다.오탄당 고리의 1' 탄소와 N-β-글라이코시드 결합에 의해 염기가 공유결합 되어 있다.인산염은 5' 탄소와 에스터 결합을 통해 연결되어 있다. 염기(base)두 종류의 모체 화합물인 피리미딘(pyrimidine)과 퓨린(purine) 유도체이다..

유전자(gene)생물의 근본적인 정보의 단위를 의미한다. 일반적으로 생물학적 기능을 갖는 산물을 만드는데 필요한 정보를 암호화하는 DNA(or RNA)의 일부분이다. 유전자의 기능1. 유전 정보의 저장과 자손으로 유전 정보를 전달2. 표현형의 발달을 조절3. 진화적 기능 유전물질 확인 실험Theodor Boveri핵이 제거된 Sphaerechinus(성게의 한 종)의 난자 세포질에 Echinus의 정자를 수정 후 발생 시킴발생된 유생은 Echinus 유생의 형태를 갖는 것을 확인함→ "유전 물질은 핵 속에 존재한다."Creighton & Mc Clintok상동 염색체를 통한 교차가 옥수수의 유전자 표현형의 변화를 가져오는 것을 증명함→ "유전 물질은 염색체에 존재한다."Griffith - 형질 전환 실험..

M-cdk의 활성 조절 S기 직후 M-cyclin 합성이 시작되고 그 농도가 높아져 M-cdk가 축적되면 M기로의 진행이 이루어진다. 하지만 처음 M-cdk 생성 시 M-cdk는 불활성화 상태이고, G2기 끝에 활성을 얻는 cdc25에 의해 억제 인산기가 제거되면서 활성화된다. 활성화된 M-cdk는 억제 인산화 효소 Wee1을 억제하면서 양성 피드백을 일으킨다. M-cdk의 M-Cyclin은 cdc20에 의해 활성화되는 APC에 의해 M기의 후기에 유비퀴틴화되어 분해되고 유사분열이 완성된다. M기의 확인 지점 중기 억류 방추사가 동원체에 붙으면서 생기는 자매 동원체의 장력은 방추사의 염색체 부착 신호가 된다. 만일, 모든 DNA가 방추사에 정상적으로 결합되어 있지 않으면 Mad2가 형성되어 cdc20-A..